Dom Afonso III

bouwde deze kerk, in rood zandsteen, tegen het eind van de 13 eeuw op de plaats van de oude moskee. De stijl is Gotisch met een plattegrond in de vorm van een Latijn kruis met drie schepen en een hoofdportaal lijkend op dat van het klooster van Batalha. De belangrijkste bezienswaardigheden zijn het gewelf en het graf van Dom João II

. Hij is gestorven in Alvor, werd begraven in de kathedraal van Silves en twee jaren later overgebracht naar het klooster in Batalha. De stoffelijke overschotten van bisschoppen en edelen van Silves liggen onder de vloer van de gangpaden en in de muren.